Koncepcja utworzenia Oddziału Transplantacji Szpiku w Klinice Pediatrii, Hematologii i Onkologii Bydgoszczy rozwinęła się w roku 2000. Na jego siedzibę wybrano IX piętro w wieżowcu Klinicznego Centrum Pediatrii. Profesor Mariusz Wysocki zaangażował się w pozyskiwanie środków na otwarcie Oddziału, a lekarze Jan Styczyński i Robert Dębski odbywali szkolenia w Poznaniu i w Nowym Jorku. Oddział został wyposażony dzięki wsparciu Fundacji Bez Barier, a jego otwarcia dokonała Pani Prezydentowa Jolanta Kwaśniewska 27 czerwca 2003 r., składając swój autograf „Z buziakami” na ścianie Kliniki. Pierwszy przeszczep rodzinny został wykonany kilka miesięcy później.

Krokami milowymi szybkiego rozwoju transplantacji komórek krwiotwórczych stały się:
• pierwszy przeszczep autologiczny w roku 2004,
• pierwszy przeszczep od dawcy niespokrewnionego w roku 2007,
• pierwszy przeszczep krwi pępowinowej w roku 2008,
• pierwsza infuzja limfocytów dawcy w roku 2008,
• pierwsza transplantacja haploidentyczna (od matki) z selekcją komórkową w roku 2009,
• pierwsze przetoczenie komórek mezenchymalnych w roku 2013.
W ciągu dziesięciu lat ośrodek stał się drugim w kraju ośrodkiem dziecięcym pod względem ilości wykonywanych transplantacji. Obecnie w Klinice wykonuje się około 35 transplantacji rocznie, a wyniki przeszczepień są takie same jak w innych placówkach. Klinika Pediatrii, Hematologii i Onkologii stosuje najnowsze metody terapeutyczne i współpracuje ze wszystkimi ośrodkami transplantacyjnymi w Polsce. Klinika jest członkiem Polskiej Federacji Ośrodków Transplantacji Szpiku oraz Europejskiej Grupy Przeszczepiania Szpiku i Krwi (EBMT) i współpracuje z wieloma ośrodkami w Europie oraz z Columbia University w Nowym Jorku.

Z okazji 10-lecia przeszczepów szpiku Klinika Pediatrii, Hematologii i Onkologii otrzymała list gratulacyjny od Pani Prezydentowej Anny Komorowskiej.